指令部は、君主、軍師、大将軍のみが閲覧、実行できます。
ただし、大将軍は、将軍系の役職変更のみ実行可能です。

::国色変更
 国の色を42色の色から変更することができます。

::指令の変更
 メイン画面に表示される指令を変更することができます。
 改行を含めて200文字まで入力できます。

::役職の変更
 国民の役職を変更することができます。
→[[役職について|役職]]

::新規入国者への勧誘文の設定
 新規登録ページに表示される新規入国者への勧誘文を変更することができます。

::国民への個宛一括送信
 国民に対して個宛を一括送信できます。

::コマンド指令
 国民のコマンド欄に６文字までのコマンド指令を表示させることができます。
 コマンド指令を入力すると国民のコマンド一覧に指令表示＆背景黄色表示され
 複雑な一斉などのコマンドを国民が入力しやすくなります。

::解雇
 国民を解雇することができます。
 解雇者は以下のペナルティを受けますので、解雇機能は十分に注意してご使用ください。
 　・解雇された武将は無所属になり、金・米・階級値が３割減少し、３日間仕官することができません。
 　　また、１度仕官するまで人数規制及び戦争中・布告中の国には仕官できなくなります。
 　・援軍者を解雇すると、援軍者は本国に強制送還させられます。
 　　援軍者の解雇の場合には、解雇された武将にはペナルティは課せられません。

::謹慎
 国民を謹慎させることができます。
 　・謹慎は徴兵コマの入力ミス（雑兵徴兵→弓兵徴兵のループ）などで、一時的に対象武将のコマンドを実行させたくない場合に使用します。
 　・謹慎させられた武将は、コマンドを再入力するまで、全てのコマンドが失敗します。
 　　※下野コマンド、および、なにもしないコマンドは失敗しません。
 　　※謹慎を使用しなくても回避できるのであれば、なるべく使わない方が良いでしょう。
 　　※一度、謹慎を使用すると、謹慎を受けた本人でなければ謹慎解除することができません。
 　　　　解雇同様、十分に注意して使用してください